「AD Conversion」を「PCM」から「DSD」に変更すると、「Trim Gain」がグレイアウトしますが、不具合でしょうか？

いいえ、これは、正常な動作となります。入力モード（AD Conversion）が、DSDになっている場合は、デジタル処理である「Trim Gain」はグレイアウトし、使用不可となります。
対して、４段階の「Reference level」はアナログ領域での処理になるため、DSD録音時でも、もちろん問題なくご使用いただけます。